備忘ログ

チラシの裏的備忘録&メモ

lme4

lme4でOptimizerを明示した場合とそうでない場合とで計算結果が異なることがあるというメモ

Rで混合モデルを検討するため{lme4}のglmer()を使っていたら、Optimizerは何もしないと"Nelder_Mead"になっている(はず)なのだが、glmer()のcontrol引数を用いてglmerControl(optimizer = "Nelder_Mead")とすると結果が異なるというということに遭遇したた…

Rのlme4パッケージで"関数 'chm_factor_ldetL2' はパッケージ 'Matrix' では提供されていません"とエラーが出た

1ヶ月ぶりくらいにlme4パッケージをつかって(一般化)線形混合モデルを計算しようと思ったら関数 'chm_factor_ldetL2' はパッケージ 'Matrix' では提供されていませんとエラーが出たので解決させたときの対応をメモしておく。 英語だと、Error in initializ…